La contaminación microbiana patógena es un problema común que reduce la productividad de suelos agrícolas. Hongos, nematodos y bacterias patógenas afectan cultivos y microflora benéfica, causando daños de diversa gravedad. Para controlar estos patógenos se emplean diversas estrategias, como variedades tolerantes, enmiendas, épocas de siembra, y desinfección del suelo por métodos físicos (solarización, vapor) o químicos. Sin embargo, cada método tiene limitaciones: los cultivos tolerantes suelen actuar solo contra un patógeno, las enmiendas requieren grandes cantidades de producto, y los desinfectantes químicos están cada vez más restringidos por sus efectos en la salud y el medio ambiente.